Clarity QSP

QSP (Quick, Simple, Pure) -быстро, просто, чисто - так кратко и точно можно охарактеризовать линейку продуктов Clarity QSP.

Clarity QSP для ТФЭ - это полимерный сорбент нового поколения для очистки синтетических ДНК/РНК , специально разработанный в дополнение к современным процессам синтеза. Испльзование Clarity QSP для очистки синтетических ДНК/РНК основано на свойстве гидрофобности тритильной группы. Гарантируется почти полное отделение защищённых тритильной группой полноразмерных цепочек ДНК и РНК от усечённых и повреждённых фрагментов и получение высокоочищенных и концентрированных целевых олигонуклеотидов.

Характеристики сорбента

Наименование продукта Clarity	Тип продукта	Основа частиц сорбента	Связанная фаза	Размер частиц сорбента, мкм	Размер пор, ?	Эффек- тивная поверх- ность, м2/г
Clarity QSP	картриджи	полимер (PSDVB)	гидрофильное полимерное покрытие	35	500	300

Упаковка	96-луночный планшет и картриджи
Тип олигонуклеотидов	ДНК и РНК
Масштаб синтеза	от 1 нмоль до 50 мкмоль
Длина олигонуклеотидов	до 100 оснований
Степень очистки	≥90%
Полнота извлечения	≥80%
Время очистки	картриджи: около 8 мин. планшет (96 образцов): около 45 мин

Набор Clarity QSP состоит из двух компонентов: загрузочного буферного раствора и полимерного сорбента. Специально разработанный буферный раствор и сорбент синергически воздействуют на сырую синтетическую смесь, обеспечивая более чем 90-процентное извлечение и очистку менее чем за 20 минут. QSP-смола pH-стабильна и очищает цепочки олигонуклеотидов длиной от 10 до 100 оснований. Степень очистки синтезированных цепочек ДНК составляет 80% и более. Очистка РНК, гораздо более сложная процедура, составляет 75%.

Обычные картриджи с обращённой фазой для удержания ДНК/РНК с тритильной защитой требуют использования токсичных ион-парных реагентов. Ион-парные реагенты часто бывает очень трудно удалить из очищенных олигонуклеотидов, особенно при работе в естественных условиях. ДНК и РНК буферные растворы Clarity QSP состоят из биологически совместимых агентов и не содержат токсичные и назойливые ион-парные реагенты.

Почти все коммерческие картриджи с обращённой фазой не предусматривают прямой или неразбавленной загрузки щелочного коктейля, тем самым ограничивается их полезность для серийной высокопроизводительной очистки. Основная цель разработки Clarity QSP состояла в том, чтобы обеспечить возможность загрузки в картридж синтезированных олигонуклеотидов из концентрированного гидроксида аммония для ДНК или триэтиламина для РНК. С Clarity QSP непосредственная загрузка стала реальностью, это экономит драгоценное время и позволяет избежать длительного этапа сушки.

Процедура очистки включает короткую подготовительную стадию и 3 простых шага для отделения целевого олигонуклеотида от примесей и неудачных цепочек.
Предварительная обработка образца. Смешиваются равные количества загрузочного буферного раствора и расщеплённой/незащищённой пробой.
Шаг 1. Загрузка сырой смеси олигонуклеотидов. После краткого кондиционирования сорбента метанолом и водой загружается сырая смесь олигонуклеотидов. Буферный раствор обеспечивает селективное удерживание защищённых тритильной группой олигонуклеотидов полной длины, в то время как не защищённые тритильной группой усечённые олигонуклеотиды и примеси проходят через сорбент. Промывка после этого шага не требуется.
Шаг 2. Снятие тритильной защиты. Для отделения от нуклеотида тритильной группы добавляется дихлорацетатная кислота. Очистка защищённых тритильной группой олигонуклеотидов вне зависимости от механизма приводит к разрушению некоторого количества пуриновых оснований. При разработке Clarity QSP значительные усилия были направлены на то, чтобы минимизировать степень повреждения олигонуклеотидов при снятии тритильной защиты. Очистка по методике Clarity QSP разрушает менее 2% пуриновых оснований.
Шаг 3. Элюирование. Добавляется pH буферный раствор. Подбор элюирующего буферного раствора осуществляется в зависимости от последующего использования синтезированного олигонуклеотида.

Буферный раствор	pH	Применение	Высушивание	Восстановление
15 мМ Na₂CO₃ / 20% ацетонитрил	7.5 - 8	исследования в естественных условиях	да	водой
20 мМ Na₂HCO₃ / 20% ацетонитрил	7.5	исследования в естественных условиях	да	водой
10 мМ Tris pH 8 / 20% ацетонитрил	8	исследования в естественных условиях	да	водой
20 мМ NH₄HCO₃ / 20% ацетонитрил	7.5	МС, ВЭЖХ, ионизация электроспрея, МАЛДИ, ЯМР	возможно	водой
15 мМ NH₄CO₃ / 20% ацетонитрил	7.5 - 8	МС, ВЭЖХ, ионизация электроспрея, МАЛДИ, ЯМР	возможно	водой
20 мМ NH₄CH₃CO₂ pH 8 / 20% ацетонитрил	7	МС, ВЭЖХ, ионизация электроспрея, МАЛДИ, ЯМР	возможно	водой

Информация для заказа

Номер по каталогу Phenomenex	Наименование	Количество
8E-S102-DGB	Clarity QSP 50 мг/96-луночный планшет	1 штука
8B-S102-DAK	Clarity QSP картриджи 50 мг/1 мл	50 штук
8B-S102-SBJ	Clarity QSP картриджи 150 мг/3 мл	50 штук
8B-S102-LFF	Clarity QSP картриджи 5 г/60 мл	16 штук
AL0-8279	Clarity QSP загрузочный буферный раствор для ДНК	100 мл
AL0-8280	Clarity QSP загрузочный буферный раствор для ДНК	1 л
AL0-8281	Clarity QSP загрузочный буферный раствор для РНК	100 мл
AL0-8282	Clarity QSP загрузочный буферный раствор для РНК	1 л